滅菌是指消除，去除，殺死或滅活所有形式的生命和存在于特定區域中的其他生物制劑（如真菌，細菌，病毒，孢子形式，朊病毒，單細胞 真核生物如瘧原蟲等），例如表面，一定體積的流體，藥物或諸如生物培養基的化合物中。
滅菌可以通過各種手段實現，包括：熱，化學品，照射，高壓和過濾。滅菌不同于消毒，巴氏消毒，因為滅菌技術可以殺死，滅活或消除存在的所有形式的生命和其他生物制劑。